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Laboratoire Bio-PeroxIL - EA 7270

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  • Attestation de déplacement dérogatoire

    Vous trouverez ici une attestation de déplacement dérogatoire : 

    attest

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  • "Biomarqueurs de la sclérose en plaques"

     

    Marqueurs biologiques de sclérose en plaques
    par Pr Éric Thouvenot*, **

    Quatre grands types de biomarqueurs sont directement liés à la maladie. Au sein de la population générale, des marqueurs de risque de sclérose en plaques sont bien établis, comme les antécédents familiaux de SEP (A). Les marqueurs diagnostiques de SEP ont évolué régulièrement, maintenant définis par la dernière révision des critères en 2017 (B). Les marqueurs d’activité de la SEP ont un rôle très important dans le pronostic et le choix des traitements (C). L’IRM et les marqueurs biologiques inflammatoires, d’activité immunitaire ou de neurodégénérescence y ont une place de choix. Enfin, des marqueurs de réponse aux traitements sont utiles à l’évaluation des thérapies de la SEP.

    Capture

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  • PRA COVID-19

    COVID 19

     

    PLAN DE REPRISE D’ACTIVITE : CONSIGNES DE SECURITE

     

    Annexes partie I : J'ai les signes de la maladie COVID-19

     

    Annexes partie II : J'ai été en contact avec une personne malade du COVID-19

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  • Proposition de stage M2 recherche Laboratoire Bio-PeroxIL, Dijon

    (Biochimie du Peroxysome, Inflammation et métabolisme lipidique)

     

    INTITULE DE STAGE M2R : caractérisation de modèles cellulaires microgliaux présentant une déficience peroxysomale

    ENCADRANTS

    Stéphane Savary, Professeur des Universités

    Doriane Trompier, Maître de Conférences

     

    CONTEXTE

    L’adrénoleucodystrophie liée à l’X (X-ALD) est une maladie neurodégénérative sévère présentant une incidence de 1 :17 000. Cette maladie est causée par une mutation dans le gène codant pour la protéine peroxysomale ABCD1. ABCD1 et son plus proche homologue, ABCD2, sont impliqués dans le transport d’acides gras à très longue chaîne (AGTLC) dans le peroxysome pour leur dégradation par b-oxydation. Le lien entre le défaut métabolique, conséquence de la mutation du gène ABCD1, et l’apparition de la maladie démyélinisante reste encore indéterminé. Les patients X-ALD ne disposent pas à ce jour de thérapie satisfaisante.

    OBJECTIF GENERAL

    Développer de nouvelles thérapies pharmacologiques et/ou nutritionnelles passe par la compréhension des mécanismes physiopathologiques en jeu. Cependant, l’étude de la physiopathogénèse de l’X-ALD est limitée par l’absence de modèles expérimentaux pertinents.

    STRATEGIE

    Etant donné que (i) la microglie est un acteur central de l’homéostasie cérébrale puisqu’elle participe au maintien de l’intégrité du réseau neuronal et myélinique et que (ii) le défaut microglial semble être l’une des causes princeps du déclenchement des leucodystrophies peroxysomales, notre laboratoire a établi un modèle d’étude microglial pour l’étude de la physiopathogénèse des leucodystrophies peroxysomales qui servira de plateforme de criblage de futures molécules thérapeutiques.

     

    RESULTATS PRELIMINAIRES

    Résultats publiés par le labo

    Les modèles cellulaires microgliaux développés sont issus de la lignée murine BV-2. Ces cellules ont été rendues déficientes en transporteurs peroxysomaux d’AGTLC (ABCD1 et ABCD2) et en enzyme ACOX1 (enzyme qui contrôle la 1ère étape de la b-oxydation peroxysomale) par édition génique CRISPR-Cas9. La validation moléculaire de ces modèles et une caractérisation préliminaire au niveau biochimique et cellulaire ont permis de confirmer les anomalies lipidiques rencontrées dans les leucodystrophies peroxysomales ainsi que des défauts d’expression de certains marqueurs microgliaux importants tels que TREM2 (1,2).

    -----------------------------------------

     1 Q. Raas, F.E. Saih, C. Gondcaille, D. Trompier, Y. Hamon, V. Leoni, C. Caccia, B. Nasser, M. Jadot, F. Menetrier, G. Lizard, M. Cherkaoui-Malki, P. Andreoletti, S. Savary, A microglial cell model for acyl-CoA oxidase 1 deficiency, Biochim. Biophys. Acta 1864 (2019) 567-576.

    2 Q. Raas, C. Gondcaille, Y. Hamon, V. Leoni, C. Caccia, F. Ménétrier, G. Lizard, D. Trompier, S. Savary, CRISPR/Cas9-mediated knockout of Abcd1 and Abcd2 genes in BV-2 cells: novel microglial models for X-linked Adrenoleukodystrophy, Biochim. Biophys. Acta 1864 (2019) 704-714.

     

    STAGE DE MASTER 2

    Analyse transcriptomique non publiée à exploiter

    Une analyse transcriptomique par RNAseq (financée par la Fondation Maladies Rares, subvention de 30 489 euros) a été réalisée sur les cellules BV-2 wt, KO_ABCD1, KO_ABCD2, KO_ABCD1_ABCD2, KO_ACOX1 traitées on non par du LPS et/ou du 25-hydroxy-cholestérol. Cette analyse a permis de mettre à jour des milliers de gènes exprimés de manière différentielle entre les cellules mutantes et les cellules sauvages, nous donnant de précieuses pistes pour caractériser les conséquences du défaut peroxysomal dans la microglie, pistes qui devront être exploitées dans le cadre du stage M2R.

    Impact de la déficience peroxysomale sur les fonctions microgliales

    En s’appuyant sur les données obtenues par RNAseq montrant une dérégulation du groupe de gènes constituant la signature microgliale homéostatique et une dérégulation des groupes de gènes en lien avec le stress oxydant et la phagocytose, l’objectif est de caractériser l’impact des déficiences peroxysomales dans les cellules microgliales au niveau:                     

    • de la signature homéostatique (déterminer les niveaux d’expression des marqueurs homéostatiques et pathologiques, WB, cytométrie en flux).
    • du stress oxydant (niveaux d’expression de protéines clés pro et anti-oxydantes, WB ; niveau de production des ROS, sondes H2DCFDA, DHE, lecteur de fluorescence sur plaque 96 puits ; niveau GSH/GSSG, kit de dosage ; dosage des activités d’enzymes anti-oxydantes ….
    • de la phagocytose (niveau d’expression de protéines clés, WB ; tests fonctionnels de phagocytose de cellules (neurones, oligodendrocytes) apoptotiques et de débris de myéline ; caractérisation des anomalies du cytosquelette d’actine, microscopie à fluorescence ; étude mécanistique avec anticorps fonctionnels / inhibiteurs spécifiques pour identifier les récepteurs membranaires impliqués…)

    Pendant le 1er semestre 2020, des analyses complémentaires seront parallèlement réalisées sur des macrophages de patients X-ALD (obtenus à partir de monocytes sanguins différenciés in vitro) en collaboration avec l’équipe du Professeur Johannes Berger, Autriche. Ainsi les résultats obtenus sur la microglie de souris seront confrontés à ceux obtenus sur des macrophages de patients X-ALD.

    Correction des fonctions microgliales – tests préliminaires

    L’effet de molécules naturelles sera évalué au niveau du stress oxydant puisque le labo a mis au point un test de dosage des ROS sur plaques 96 puits permettant de faire du criblage. L’activité biologique des molécules issues d’huile d’argan, de raquettes de cactus, d’huile d’olives, de vin, de grenade et d’eucalyptus s’intègre au sein du consortium Franco-Allemeand NutRedOx. Il restera à mettre en évidence si les molécules sélectionnées sur la base d’un stress oxydant corrigé, permettront également de corriger les fonctions microgliales étudiées dans le cadre du stage de M2R, à savoir rétablissement de la signature homéostatique et retour à une capacité normale de phagocytose.

    PERSPECTIVES

    Intitulé possible de la thèse qui fera suite au M2R : modèle cellulaire de phagocytose comme outil pour identifier de nouvelles cibles thérapeutiques dans l’adrénoleukodystrophie liée à l’X.

     

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  • Cyto Magh 2018

     

    Télécharger la plaquette ICI

     

    Conférence 1 (en diaporama ici) :
    Caractérisation et méthodes d’études de la mort cellulaire par cytométrie en flux

     

    Conférence 2 (en diaporama partie 1 ici) (Partie 2 ici):
    Cytométrie en flux appliquée à l’étude de :

    • La prolifération et du contenu en ADN
    • La viabilité cellulaire
    • Des organites cellulaires
    • Du stress oxydant et de l’inflammation (analyse multiplexe)

     

    Conférence 3(en diaporama ici) :
    Métabolisme Lipidique et Mort Cellulaire

     

    Conférence 4 (en diaporama partie 1 ici) (partie 2 ici):
    Analyses Cytokiniques par Cytométrie en Flux

     

    cyto2018mag

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  • Master 1 Santé (Faculté de Médecine) UE Biochimie Métabolique et Régulation

     

    Cours de Gérard Lizard : Lipides et Mort Cellulaire (Faculté de Médecine)

     

    - Apoptose, Nécrose/Nécroptose, Pyroptose et Autophagie : Caractéristiques et Méthodes d’Etudes (le cours en diapo)

    - Alternatives à l’Expérimentation Animale 

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  • NMS Adhérents

    NMS se développe et se diversifie d'années en années.
    Parmi les pays du pourtour méditerranéen nous comptons outre la France (Bourgogne-Franche-Comté, Rhône-Alpes-Auvergne, PACA, Ile de France), l'Espagne, l'Italie, le Maroc, la Tunisie, l'Algérie, et le Liban. Et parmi les professions, on trouve des chercheurs académiques, des chefs d'entreprises, des éditeurs, des médecins, des pharmaciens, des vignerons, des nutritionnistes, etc.

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  • NMS Newsletters

    Le 4 juillet dernier une équipe de tournage de la télévision brésilienne Globo est venue à l'Université de Bourgogne, laboratoire Bio-PeroxIL interviewer le Professeur Norbert Latruffe, Président de NMS, sur le thème "Quoi de nouveau sur le resvératrol" depuis l'émission de 2009.

    15 novembre 2018 - Newsletter

     

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  • NMS agenda

    • L'assemblée générale de NMS 2019 se tiendra à Arbois (Jura) le 1er juin 2019 suivie d'une session scientifique "sur les traces de Pasteur de du vn jaune"
    • Rappel : l'assemblée générale de NMS 2018 s'est tenue le samedi 9 juin 2018 à la cave de Tain l’Hermitage (Vallée du Rhône) (Programme de la journée ici ...)

    <AG NMS Tain 2018

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  • NMS bourse jeunes chercheurs

    Bourse de voyage NMS 2019


    L’association Nutrition Méditerranéenne et Santé (NMS) offre une bourse avec le soutien de Madame Claude Taesch-Mesnage à un(e) étudiant(e) de Master 2 ou de Doctorat méritant(e).

    La bourse, d’un montant de 500 €, est destinée à contribuer à couvrir les frais d’un séjour de recherche ou présenter ses résultats à un congrès (poster ou communication orale) en 2019.

    • Le thème couvert devra concerner la nutrition (si possible de type méditerranéenne) en relation avec la santé. Il inclut le vin et ses composants, les ingrédients d’une cuisine saine et de qualité.
    • Les aspects relevant des sciences humaines, économiques et sociales seront également considérés.

    Le dossier de candidature devra être envoyé avant le 15 décembre 2018.
    La notification des bourses aura lieu début 2019.
    Le dossier devra comprendre :

    • Le CV (1 page)
    • Pour un congrès, une copie du résumé (1 page) et de l’acceptation du comité d’organisation
    • Pour un séjour de recherche, le projet de recherche (1 page) et l’adresse et les dates de séjour.

    Site NMS : http://anms.e-monsite.com/pages/les-actions.html
    Le dossier est à envoyer en version électronique au Président de l’association NMS :
    Prof. Norbert Latruffe, Université de Bourgogne. Laboratoire Bio-PeroxIL, 6 Boulevard Gabriel, F21000 Dijon France - Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.

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